在苏军进攻的当天，731部队是处于何种状态呢？据许多原部队人员做出的一致的供词，8月9日那一天，石井四郎部队长不在平房。部队像平时一样地执行任务。苏联空军飞机已在中国东北各地开始轰炸，而731部队全体人员还很平静，这是一件怪事。但是，有一种说法是：731部队的gān部都飞往各支队，正在指挥向通化转移，石井部队长从长chūn的关东军司令部发给731部队的密码电报由于无人译码而原封不动地放在部队里，这就是8月9日“731部队保持平静”的原因。
731部队人员从8月9日夜里开始为之骚动。这一天夜晚，出现在哈尔滨上空的几架战斗机投掷了照明弹。这些都是苏联空军的飞机。
哈尔滨被照得满天通亮，市民吓得目瞪口呆，街上乱成一团，甚至连空袭警报器都没有响。
731部队人员和他们的家属在防空dòng里度过了一个不安的夜晚，因为有的情报说：“苏军已bī近哈尔滨。”
10日清晨，收到关东军司令部致石井部队长的一份电报：“立即前来接受命令。”
但是，石井部队长不在部队，他的行迹是秘密的，谁也不知道。部队gān部慌忙利用飞机把N副官送往长chūn。
N副官到关东军司令部一看，关东军司令山田乙三以及各位参谋都巳飞往各地，那里没有一个负责gān部。不断收到来自中国全国各地的紧急电报，询问有关陆军参谋本部指示的电报……关东军司令部像发生火灾的现场那样骚动起来。
N副官报告说前来领受命令，关东军司令的命令是：“苏军的进攻速度极为迅速，关东军各部队也都开始转战南下，731部队可以独断专行。”
独断专行是关东军的“绝招”，制造诺门坎事件，从柳条湖事件到进攻奉天，关东军一直无视本国政府的训令，一口气扩大了对中国的侵略。
但是，8月10日凌晨，731部队接到的可以“独断专行”的方针是尽快“转战”，所谓“转战”就是逃跑、撤退的代名词。
N副官8月10日中午回到731部队，接到“独断专行”、“转战”的命令以后，731部队高层机关骤然间紧张起来。
如果平房落到苏军手中，恶魔对3000多名“马鲁太”进行活体实验的所作所为就完全bào露出来，731部队全体人员将被追究战争罪犯的责任。
“即使不出现这种局面，最终全体人员也免不了遭到枪杀……”
他们围着副官举行了紧急会议。
残杀“马鲁太”的真相
领受关东军司令部可以“独断专行”的命令之后，没有一个人能够准确地忆起从N副官8月10日中午回到731部队起至8月15日期间的严重混乱的情况了。
据认为，实际的撤退工作是从10日晚上开始的，但是，关于作业内容、程序、时间和地点等的记忆因人而有所不同。“总之，象做恶梦似地过着混乱的日子”。只有这一点是一致的。
据说，石井四郎是8月10日夜回到731部队的，关于这一点，也不了解确切的情况。
再次召开关于撤退作战的gān部会议，会上，石井部队长和jú地少将（第一部长）等人的意见严重分岐，双方进行了激烈的争论。
石井部队长的撤退方案：（一）保守“731的机密是最大的问题；（二）为此，已派西中佐（教育部长）前往地处苏军进攻线上的海拉尔、林口、孙吴和牡丹江支队，命令部队人员销毁证据，全体自杀；（三）同样，也命令住在东乡村宿舍的部队人员家属和全体人员自杀；（四）一个也不留地杀掉目前关押中的”马鲁太“，同时”彻底“毁掉”口“字楼，部队设施由工兵负责进行爆破；（五）尔后，包括少年兵在内，整个部队在严密的统率下南下至通化。
石井部队长和jú地部长进行激烈争论的原因，在于石井方案中的（二）和（三）。jú地少将认为：“731部队内有许多有才能的研究人员，与其qiáng迫他们白白自杀，不如想出一个拯救支队的方法，这才是先决条件。”他气愤地说：“部队长应努力率领部队人员的家属先回国。”对石井部队长平日沉迷于酒色、工作放dàng的态度，许多gān部一直是很不满的。
结果，石井部队长做出让步，得出结论是“马上开始撤走家属，部队长前往各处，找火车，指挥各支队撤退。”石井部队长再次从731部队中消失。
其间，石井四郎gān了三件事：第一，把731部队为进行细菌战准备而积存的各种资料和庞大的实验资料、菌株等送回日本进行准备；第二，安排731部队撤退列车优先通过，以免被苏军逮捕。为此，石井四郎充分利用731部队航空班的军用飞机，飞往长chūn、沈阳等城市。
石井四郎gān的第三件事是：特别班人员的紧急避难。千代田村里有一个叫做加茂的小村落，特别班人员多是这个村落人，就是今天千叶县芝山町加茂地方。石井四郎于1933年创建细菌战部队时，把部队起名为“加茂部队”。这一名称的由来就是这一村落，特别班名副其实地是731部队的核心骨gān。
“处理‘马鲁太’以后，全体人员立即紧急撤退……”，这是石井部队长对特别班人员下达的手谕。即在731部队中优先安排同乡出身的特别班人员逃跑。
来自平房站的货车已有三列进入了731部队的专用铁路线，这些满载特别班人员和贵重资料的货车11日从平房发车。
据说，至8月10日，被关押的“马鲁太”总人数已不到40人，关于如何处置掉“马鲁太”的问题，有关人员过去有种种说法，如“用氰酸化钾毒死”、“全部枪毙”等等，其中有的说法还印成文字。真相究竟如何呢？
据我的调查，“马鲁太”是用毒瓦斯杀害的。据说，犯人发生bào动以后，特设牢房换气系统很快把毒瓦斯注入了毒气管道。
“简直像观看大猩猩在善栏里发狂一般……”，这是一个亲眼看见残杀全体“马鲁太”情景的部队人员说的。
在“马鲁太”中，有几个人未被毒瓦斯杀死，他们敲打着铁门，发出令人恐惧的吼声，乱挠着喉咙，无比的痛苦。特别班人员慢慢地走近不胜痛苦的“马鲁太”跟前，对准他们的脑门扳动了毛瑟枪扳机。“不断地拖着杀掉了的‘马鲁太’”的腿，扔到7号楼旁的一个大坑里，浇上汽油和重油，点了火……我记得，那是11日下午的事。为了进行烧毁，731部队的焚尸炉里塞满人头标本、培养细菌用的琼脂、大量的文件和器具等。……‘马魯太’的尸体不太容易烧掉，可是撤退工作正在争分夺秒，慌忙逃跑的特别班人员们把尸体烧了一半就埋上土逃之夭夭……因此，有的尸体手脚从土中露了出来，难以发挥掩盖罪行的作用。部队gān部看到这种情况后命令说：‘再把尸体挖出来彻底烧掉……’负责挖掘瞠目硬挺的‘马鲁太’尸体的部队人员边恶心边进行挖掘“，一个部队人员回忆道。