平良兼回到领地，越想越气，就写了一封状子到朝廷把平将门给告了。
自称天皇扯反旗
平安京的朝廷收到这一封状纸之后，下诏让源护和平将门到京城来对质。
平将门一介武夫不敢违抗朝廷的旨意，到了京都被朝廷的威严所震慑，吓得战战兢兢。没想到当时正赶上朱雀天皇的成年大典，所以他并没有受到追究，被恩赦返乡。而且他在京都的时候，朝中的很多公卿大臣还夸耀他的武勇：你真牛，人家兵力比你qiáng，你居然还把你的伯父和你对手的仨儿子全宰了。
诚惶诚恐的平将门不但没有受到任何处罚，还得到武勇的赞誉，更是得意扬扬。他的二伯父平良兼以及他的堂兄平贞盛，本来以为平将门到了京都必被朝廷处罚，没想到他什么事儿都没有，大摇大摆地又要回到东国。两个人非常生气，决定在平将门回去的路上把他给宰了。没想到平将门真是天生神力，武勇过人，在二伯父和大堂兄的围攻之下愣是杀开了一条血路，毫发无伤地逃走，回到自己的领地之后，整备兵马来跟二伯父和大堂兄决一死战。
平将门为报偷袭之仇，此战更是一马当先，冲入敌营当中，如虎入羊群一般，势不可当，大获全胜。
平贞盛觉得仅仅凭借自己和二伯父无法解决平将门，但杀父之仇不能不报，只好再次进京告御状。平贞盛行至中途，被平将门拦截，手下的一百多名骑士全部被歼。幸亏平贞盛武艺还算高qiáng，只身逃离。
平贞盛到了京都向朝廷控诉了平将门的恶行，朝廷赐给他一道兵符，让他到地方上征调兵马，征讨平将门。但万万没想到的是，这个时候关东五国的国司被平将门的威严震慑，根本就不敢去讨伐平将门，反而纷纷上书朝廷给平将门说好话。眼看报仇雪恨无门，二伯父平良兼忧恨而死，平贞盛也只能躲藏起来等待时机。
此时的平将门志得意满，看到朝廷拿我都没辙，关东五国都听我的，野心就越来越大。他袒护朝廷要抓的常陆地区的豪qiáng，因此常陆国司藤原维几率领三千大军前来追捕，但被他打得落花流水，连藤原维几也被活捉了。这一仗平将门大显威风，逞了一时之快，可是性质发生了变化，这就不是私斗了，而是公开反叛朝廷。
平将门一看大错已然铸成，gān脆一不做，二不休，索性反了。正式打出反旗之后，平将门由常陆转攻下野国，势如破竹，然后攻取上野国，一时间，好不得意。他在上野国司的官厅里大宴诸将，席间谁也没注意，一个女巫突然闯了进来，走到平将门的座前就开始浑身哆嗦，然后倒地不省人事。
平将门跟众将面面相觑，这个娘儿们怎么回事儿?此时，女巫站起来说：我是八幡大菩萨的神使，代大菩萨传旨，平将门是皇孙嫡系，现在天皇无道，藤原氏弄权，民生疾苦，令平将门承袭皇位，另外派右大臣菅原道真为帅，统兵八万相助平将门。
菅原道真是著名的儒臣，为官清正，深得老百姓爱戴。在宇多天皇时代，天皇为了抗衡推行摄关政治的外戚藤原氏，对道真任以要职，却让道真成为藤原氏的眼中钉，最后横遭陷害，流放冤死。他死后不久，日食、月食、彗星、地震、落雷、旱灾、豪雨、大火、疫病等重大灾难接连爆发。紧接着，陷害他的主谋藤原时平死了，藤原清贯也在清凉殿被雷劈死。总之一句话，凡是当初参与陷害菅原道真的人，一个都没好下场，不是出游时被雷击死，就是无故bào病身亡。
当时的人们认为这一切都是菅原道真的怨灵诅咒所致，因此，菅原道真也被列为日本四大怨灵之首。后来日本又把菅原道真奉为雷神，奉为学问之神。直到今天，日本全国各地都有祭祀菅原道真的天满宫，每年年初，学生们都会来祈愿道真保佑考试顺利。
平将门与众将一听女巫所言，联想到当今把持朝廷的太政大臣藤原忠平就是当年陷害菅原道真的藤原氏之后，于是都信以为真。在座的诸将朝拜平将门，推举他为新天皇。
平将门非常高兴，自号新皇，仿照京都朝廷设立文武百官，把辅佐他的兄弟叔侄一帮人全封为大臣，然后率领大军西上，准备推翻天皇政权，改朝换代。
怨灵作祟很离奇
由于事发突然，当时摄政的藤原忠平和小天皇朱雀吓得是魂不附体。日本好几十年没打仗了，文恬武嬉，现在出了平将门这么一个刺儿头，大军浩浩dàngdàng杀向京都，可怎么办?朝廷赶紧起用平将门的死对头平贞盛，并且请出了一位老参议——六十七岁的藤原忠文，拜他为征东大将军去讨伐平将门。
平贞盛这个时候仍然流落在东国，四处躲藏，生怕落在平将门手里。得到朝廷讨伐平将门的圣旨，平贞盛喜不自胜，可算是等到今天了。平贞盛报仇心切，很快就联络下野国的藤原秀乡，召集人手去袭击平将门的部队，展开了游击战。
朱雀天皇天庆三年(940年)，平贞盛、藤原秀乡的部队跟平将门的部队展开了混战。平将门的部队一开始进展顺利，因为风势是chuī向对方的。平将门的部队顺着风势，就像平添了千军万马一般，大肆砍杀平贞盛和藤原秀乡的联军。平将门杀得正顺手的时候，风向突然发生了变化。虽然还是狂风大作，飞沙走石，但此刻轮到平将门叫苦了，方才的优势一下变成了劣势。
平贞盛在溃逃之中掉转马头，反攻平将门。平贞盛远远望见平将门单骑在前，搭弓扣箭，一箭she去，正中平将门面门。平将门应弦坠马，藤原秀乡赶上去补了一刀，把平将门枭首。平将门的新皇美梦前后只做了七十多天，比袁世凯还短。从京都出发的以藤原忠文为首的讨伐军，还没有进入战场就收到了平将门已被枭首的捷报。
可是杀死平将门之后，平贞盛和藤原秀乡在当天晚上就遇到了非常奇怪的事儿，看守平将门遗体的士兵来报告，平将门的遗体不见了。当平贞盛和藤原秀乡去看示众的平将门首级之时，平将门的首级突然睁开眼，对着两个人大笑，说你们不过就是砍我一个脑袋罢了，你们别得意，我不会就这样死的，我要永远诅咒你们的子孙，之后自然会有人找你们报仇雪恨。
俩人吓得是面面相觑。平将门的首级被快递到京都，呈朱雀天皇龙目御览。他的首级是装在木盒里的，一打开木盒，天皇和文武公卿当时就吓瘫了，胆小的更是吓得大小便失禁，为什么呢?因为木盒里的平将门首级一脸愤怒，睁着双眼，嘴里发出牙齿咬合咯吱咯吱的声音。
更为恐怖的是，藤原忠平命人把平将门的首级拿到京都示众，没几天京都就开始闹鬼，不断有人看到很多身穿铠甲的武士出没在平将门首级周围，凡是看到的，回去都发病，还有人说听见平将门的首级发出很大的笑声。
半个月之后的一个白天，正在很多人围着平将门的首级观看的时候，首级突然发出了一声咆哮，冲天飞起，一路向东，好像要跟自己的身子会合，最后飞到武藏国的鸟越附近落了下来。
朝廷为了安抚平将门的怨灵，在今天东京都千代田区的大手町建立了平将门的首冢。几百年之后，德川氏入主江户城的时候，又在江户的神田修复重建了神田明神神社来祭祀平将门。