话是这样说，他自己可能也有顾忌，所以举棋不定，始终未见他上疏。任克溥的心思却是大为活动了——前明遗留以来的“南北之争”，依然未消；北以山东大老为首，南由江浙大臣领导；任克溥受了冯铨和刘正宗的指使，久已想“荼毒南士”，得此机会，自然不肯放过。不过江南籍的几名大学士和部院大臣，也不是好惹的；因而任克溥犹不免观望。
就在这时候，皇帝在南海子召见汉大臣及给事中、御史等言官，很严厉地面谕须各尽职掌，不得徇私包庇。任克溥一想，趁个风头上，正该奋力一击，于是十月十六日上了一道奏疏，严劾北闱弊端，以蒋文卓和张汉所投送的揭帖为凭，并举陆贻吉作证。
此疏一上，皇帝大怒，传旨拿捕奏疏中指明的人犯，由吏部及都审院会审。
结果审实有五名房官卖了关节，他们是李振邺、张我朴、蔡元禧、项绍芳，还有一个就是陆贻吉。举人贿通有据，亦有两人。奉旨：“俱着立斩，家产籍没，父母兄弟妻子俱流徙尚阳堡。”主考曹本荣、宋之绳亦jiāo部议处。
这不过是北闱弊案的开端，吏部尚书王永吉，蓄意要兴大狱；于是灵秀手中的一张单子，便成了极重要的证据。
此是李振邺的疏忽，当他用蓝笔亲写二十五个人的关节，嘱咐灵秀去“摸索”以后，原该将单子收回销毁，而竟忘却其事，偏偏灵秀又拿给他的同事冯元看，李振邺御下无恩，冯元久已怀恨在心；这张关节单子如至宝，想用来威胁李振邺。不知如何，王永吉也听说有这样一张单子，因而向满洲籍的大学士图海，和满缺的吏部尚书科尔坤建议，据此追查关节。
“什么叫关节？”来自关外的图海，始终还不明白。
于是王永吉掀髯抵掌，把什么叫关节，如何使用，怎样不易为人所发觉，以及如何付款？原原本本地讲解了一遍。
“这就有疑问了。譬如，我向你买关节，先付一半；等中了以后，那一半不付，你又奈我何？”
“怎样无奈何？”王永吉答道：“买关节的人有借据在别人手里。”
“这又有疑问的了，倘或不中，这一半自然不付；而执有借据的考官，告到当官打钱债官司，不中的那人，岂不吃亏。”
“不要紧，借据有个写法，具名是‘新科举人’某某，既然不中，便不是新科举人，不问可知，借据无效。”
“啊——！”图海大摇其头，“南蛮子真狡猾！”
有了这句话，便是被说动了，主张严办；王永吉得此支持，大为高兴，把冯元找来，好言问道：“你把那张单子拿出来，将来一定有赏。不要紧，凡事有我作主！”
呈上单子，调原卷核对，李振邺所卖出的关节，第一名叫做陆庆曾，捉拿到案一问，陆庆曾承认有此事，但关节不是买的，是李振邺所送：因为他曾医好了李振邺的病，藉此以为酬报。
不管是买是送，总是关节，陆庆曾当然被逮下狱。再调第二名的卷子一看，王永吉的神色大变！
“图中堂！”王永吉嗫嚅着说，“我，我要回避！”
“怎么回事？”
“唉！”王永吉长叹，“家门不幸，有此不肖子。真正是无从说起了！”
“到底怎么回事？”图海性子急，“请你明说。”
说出来无不诧异，这一本卷子的王树德，就是王永吉嫡亲的侄子，不知如何也通上了李振邺的关节。
于是王永吉上疏自劾。皇帝公事公办，批复：“王树德审明处分，不必先期陈乞。”同时下旨，将关节单上的二十五个人，连家属一起捉拿到案，关入刑部大狱。
北闱弊案未了，南闱又起了极大的风波。给事中yīn应节参劾江南主考方犹舞弊，其实是跟方拱乾父子有嫌隙，借以相攻，所以他的奏疏是这样写的：
江西主考方犹等弊窦多端，物议沸腾，其彰著者，如取中之方章俄，系少詹事方拱乾第五子，玄成、亨咸、膏茂之弟，与犹联字有素，乘机滋弊，冒渎贤书，请皇上立赐提究严讯。
主考舞弊，却说“冒渎贤书”，其意在方章钺；而方章钺还在江南，那么“请皇上立赐提究严讯”，便隐隐然是指方拱乾和方玄成父子了。yīn应节这道奏疏显然别有用心；当山东大老，正在“唯恐天下不乱”，掀起大狱之际，不能不令人怀疑，山西洪dòng县人的yīn应节，是受了刘正宗的指使，要对方拱乾报当年不肯明指太子假冒的仇。
皇帝对考试舞弊的案子，深恶痛绝，因而一接yīn应节的奏疏，立即召见方玄成—一这时自然不会叫他“楼冈”了，疾言厉色地责问，可有其事？
“臣家桐城，已历数世。江南主考方犹是浙江人，从未同宗，臣弟章钺，不在回避之列。”
皇帝听得这样回奏，脸色缓和了些，“我想你家的人，亦不致要靠关节，才能中举。”他说，“不过此案既然从严办理，方章钺亦不能例外。”
“是！臣不敢以私情坏皇上的大法，乞赐拿问。果然不肖，臣弟自耷应得之罪；否则便是皇上为臣弟洗刷，还他清白，臣父亦同感天恩。”
“嗯，嗯！”皇帝撇开方章钺，就事论事：“江南闱到底如何？乡试至今已在一个月，总有江南来的人，可曾听到些什么消息？”
“流言甚盛，只是真伪难明，不敢妄奏。”
“不妨！你说来我听听。”
方玄成不敢隐瞒，把所听到的消息，细细面奏，据说南闱发榜，士论大哗，好事者做诗做文章、做杂剧、传奇，把方犹、钱开宗骂得不亦乐乎。甚至船过苏州等地，一路有人跟着船骂，再激烈的，便拾取砖瓦投向船头，吓得方、钱一二人在舱中发抖。
“真是斯文扫地，rǔ及朝廷！方犹、钱开宗太可恨了！非严办不可。”皇帝又问，“好事者是怎么说？可有他们做的诗文？抄来我看。”
方玄成当时就找到了两本传奇，都是江南新刻的，一本名叫《万金记》，万是小的万字，加一点成方；金字则为钱字的一半，所以“万金”二字，即是影she方、钱两主考的姓。其中描写通贿的情景，历历如绘，只是姓名都已隐去。
另一本叫做《钧天乐》，也是写科场故事，主考名叫胡图，是“糊涂”的谐音；三鼎甲名叫贾斯文、程不证、魏无知，谐音为假斯文、真不证、鬼无知。作者是号叫西堂的尤侗。
“尤西堂是老名士，必不妄言。”皇帝重新加qiáng了决心，一定要严办。
于是一道上谕，颁行江南，上面是这样指示：据奏南闱情弊多端，物议沸腾，方犹等经朕面谕，尚敢如此，殊属可恶。方犹、钱开宗并同考试官，俱着革职，并中试举人方章钺、刑部差员段速拿来京，严行详审。本内所参事情及闱中一切弊窦，着郎之佐速行严查明白，将人犯拿解刑部，方拱乾着明白回奏。