熊廷弼在辽东与众将官同甘共苦，爱护部下。他的军令虽严，可是人们都心服口服。总兵、将吏关系处理的比较好。他们宰牛歃血共立誓言，决心同舟共济。督促士卒认真操练，每队以一教五。还规定训练要求，每日每人必须以数百矢试she[38]。熊廷弼也含辛茹苦，亲自到海州、盖州去督饷，竭力计谋，致使食不甘味，夜不成寐。在熊廷弼十个月的经营下，辽东的形势大变。明朝的官员称赞说，熊经略把辽东的冰消瓦解局面，改变成了珠联璧合的形势。
在熊廷弼实行“步步为营，渐进渐bī”之策的时候，努尔哈赤的兵锋也由辽南转向了辽沈腹地。努尔哈赤认为，只要取得辽沈，辽东诸地，如宽甸、叆阳、镇江等地，便可以唾手而得，因此，他除了派出小股部队，频频袭扰明边，掠夺粮食外，有时也派出大部队向辽沈冲击。同年六月十二日，努尔哈赤亲自统率大军，兵分两路，一路集结轻骑五万，从抚顺关入明境，直趋沈阳;一路约一万多骑兵，由东州沙地冲入明境，直抵奉集堡。努尔哈赤所率领抚顺路军袭击大小村堡四十多所，掠获男女数千口，直到距离沈阳城五里才停止前进。初战，明军坚守沈阳城池不出。努尔哈赤以为招降沈阳守军，易如反掌。但是，辽沈在熊廷弼的经营下，官兵的军纪整肃，官将合力，将卒同心，人人肯于搏战。总兵李怀信统兵四万坐守沈阳，总兵官贺世贤提师迎战于沈阳东二十里，与八旗兵战于浑河沿岸，柴国柱从奉集堡出兵与八旗兵战于沈阳东三十里的小夹山，努尔哈赤面对前有坚城，后有追兵的不利情况下，不得不后退十五里。可是，明军又改变战术，贺、柴两军一南一北向努尔哈赤的大营兵首尾挟击而来，同时，沈阳城四万大军又从西边平推bī近。努尔哈赤这次出兵的目的是孤悬沈阳，故注意破坏边台小堡，夺取谷物，加上有轻敌思想，没有决战准备，也更没有料到熊廷弼将辽军整顿得如此有成效。所以，在熊廷弼初战力挫八旗兵锐气，又三面bī进摆出决战架势的时候，努尔哈赤来不及部署，八旗兵便纷纷退却，丢梯失牌三十多副[39]。十五日，达尔汉统兵一万转到沈阳北境。十六日，皇太极率兵八百，再掠沈阳以东居民一千多口。这次出兵共掠沈阳东部、北部居民四千多人，夺取大批谷物后，退兵东归了[40]。同年八月，努尔哈赤又两次向懿路、蒲河(今沈阳市东南浦河)进军。莽古尔泰、额亦都等还统兵与明军战于沈阳东南，掠取八千多口人和大批的谷物而回[41]。
大英明汗努尔哈赤，虽然频繁地派兵冲击辽沈，但多是小胜小败，一直没有大的军事行动。其中主要的障碍是熊廷弼产守边防，使其不得发展。明人说：“熊公在辽言辽，明了畅快，一一指掌而尺寸无差”[42]。熊廷弼的守辽规划是，拟用兵十八万，四路驻军，各守险要，相互协同、联络，居行都有规定[43]。但是，当援辽兵马刚刚集中了十万多，朝廷内部诽谤他的声làng就高涨起来，迫使他不得不解职回籍。熊廷弼离辽，后金与明廷的军事对峙便宣告结束了。
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[1]茅瑞征：《东夷考略》页23(建州)。
[2]范世济：《火速调兵遣将疏》，参见《筹辽硕画》卷25。
[3]李民寏：《建州闻见录》，参见辽宁大学历史系编：《清初史料丛刊第八、九种》页46。
[4]李民寏：《栅中日录》，参见辽宁大学历史系编：《清初史料丛刊第八、九种》页19。
[5]《朝鲜李朝实录·光海君日记》卷143：“差官送揭帖于王曰：……以开原新破，贼势愈昌，故欲烦鸟铳手以为守城之具，亦籍贵国相援之虚声，使酋少惮也。……遇谓兵之当发者有六，……新经略熊老爷到任，旗鼓一新，此番征调天下兵马，必用三、四十万方进贼巢，兵齐之日，贵国发数万……。
[6]李民寏：《栅中日录》，参见辽宁大学历史系编：《清初史料丛刊第八、九种》页19-20。
[7]李自用：《敷陈末见疏》，参见《筹辽硕画》卷43。
[8]王在晋：《议固以防海运疏》，参见《筹辽硕画》卷27，熊廷弼：《恭陈初到事宜疏》，参见《筹辽硕画》卷28。
[9]熊廷弼：《战守已无可支俾作区处疏》载：“况辽人，……贼杀其身及其父母、妻子不恨，而公家一有差役则怨不绝口，贼遣为jian细，输心用命，而公家派令守城，则职虽以哭泣感之，而亦不动”，参见《筹辽硕画》卷29。
[10]王在晋：《议固以防海运疏》，参见《筹辽硕画》卷27，熊廷弼：《恭陈初到事宜疏》，参见《筹辽硕画》卷28。熊廷弼：《正军法定官守疏》，参见《筹辽硕画》卷29。
[11]熊廷弼：《新兵全伍脱逃疏》，参见《筹辽硕画》卷37。
[12]《熊经略集》卷1。
[13]晏文辉：《上下志狃因绪疏》，参见《筹辽硕画》卷28。
[14]熊廷弼：《请发军器疏》，参见《筹辽硕画》卷28。
[15]熊廷弼：《战守已无可支俾作区处疏》，参见《筹辽硕画》卷29。
[16]熊廷弼：《催兵愈严虚应如故疏》，参见《筹辽硕画》卷36。
[17]熊廷弼：《催兵愈严虚应如故疏》，参见《筹辽硕画》卷36。
[18]熊廷弼：《严敕催发粮草疏》，参见《筹辽硕画》卷41。
[19]《满文老档·太祖》卷14，李民寏：《栅中日录》，参见辽宁大学历史系编：《清初史料丛刊第八、九种》页22-23。前书记载筑四城，后书记载筑五城，按五城算，应有抚顺包城，即以明边墩台乱砖碎石筑的临时设防城堡。
[20]《满文老档·太祖》卷14，陈王庭：《速议将兵以济燃眉疏》，参见《筹辽硕画》卷29。
[21]《朝鲜李朝实录·光海君日记》卷152。
[22]王在晋：《议固以防海运疏》，参见《筹辽硕画》卷27.huáng克缵：《建夷谋犯益工疏，，参见《筹辽硕画》卷42。
[23]熊廷弼：《催兵愈严虚应如故疏》，参见《筹辽硕画》卷36。
[24]熊廷弼：《新兵全伍脱逃疏》，参见《筹辽硕画》卷37。
[25]薛凤翔：《兵逃当问马倒有因疏》载：“且闻奴中岁凶人众，虽所掠金、帛不赀而实乏食……”，参见《筹辽硕画》卷41。
[26]李民宾：《栅中日录》.参见辽宁大学历史系编：‘清初史料丛刊第八、九种》页24，熊廷弼：《恩赉慰劳官兵疏》，参见《筹辽硕画，卷44，陈王庭：《补道臣发兵将疏》，参见《筹辽硕画》卷45。
[27]huáng克缵：《建夷谋犯益工疏》，参见《筹辽硕画》卷42。
[28]左光斗：《愤rǔ徒空雪耻未实疏》，参见《筹辽硕画》卷45。
[29]《满文老档·太祖》卷15。
[30][31]熊廷弼：《恩赉慰劳官兵疏》，参见《筹辽硕画》卷44。
[32]熊廷弼：《钱粮缺乏至极疏》，参见《筹辽硕画》卷37。
[33]熊廷弼：《严刺催发粮草疏》，参见《筹辽硕画》卷41。
[34]刘尉：《边镇告急币藏空虚疏》，参见《筹辽硕画》卷40。