明廷的方针是坚持扶立王台的后人虎儿罕做南关的主持人，目的是继续分隔东部女真与西部蒙古联系，不使建州阿台与北关叶赫部、蒙古合兵。具体策略是暂挫北关叶赫部的锐气、阻止西部蒙古部东进，以集中兵力打击王杲的儿子阿台，清除“祸本”。这就是努尔哈赤父、祖被杀前辽东的政治形势。
开始的时候，边官谕令北关逞加奴、仰加奴和南关虎儿罕缚献阿台、阿海兄弟，将打击的重点放在建州。但阿台负险自固，拥兵设防。南北两关由于苦斗多年，都不具有当初王台的势力，想让其缚送阿台兄弟已经不可能了，剩下的选择只有官方出兵剿杀阿台一条途径了[4]。
万历十一年(公元1583年)正月，王杲之子阿台结连西部蒙古部瓜儿兔、huáng台吉，预谋掠夺广宁、开原以及辽河一带。
明辽东巡按等官也最怕东西两部合兵。阿台的行为正与边关的意向相抵牾，总督周泳、巡抚李松、宁远伯李成梁等，鉴于这种局势，决意出兵讨伐阿台。
同年二月，建州图伦城(今辽宁省新宾县汤图境内)主尼堪外兰向边关密报情况，引导官军进攻阿台驻守的城塞。李成梁统率广宁、辽阳官兵，分两路挺进。一路由他亲自统领，从抚顺王刚台出兵，奔驰百里，直捣阿台所踞的古勒寨(今辽宁省新宾县上夹公社古楼村西北山上);另一路由秦得倚统率，直趋阿海所踞守的沙济城(亦书夏古城，属苏克苏护河部)。官军突然来到，阿海无备，来不及设防，部下半数入城，半数逃走了。官军乘乱破城，阿海被杀，秦得倚大获全胜。李成梁所部官军同时也围困了古勒城，因为此城依山据险，阿台固守甚严。李成梁亲临督战，战斗十分激烈。官军连续攻城两昼夜，仍未攻下。面对这种情况，宁远伯李成梁大为恼火。在这进退维谷时，李成梁责怪图伦城主尼堪外兰，乱进“谗言”，引导官军攻城，以致劳兵损名。尼堪外兰受重责后，便伙同官军欺骗守城军民说：太师(系指李成梁)有令，杀死城主归降的，任命他作本城城主。在这以前，城中的人心早已动摇了，听了尼堪外兰的话，便深信不疑，纷纷倒戈，杀死城主阿台，开门迎降。然而，李成梁在破城后，自食其言，竟纵兵大肆屠杀城中老幼，结果被杀的无辜军民多达二千二百多人[5]。
努尔哈赤的祖父觉常刚，在王杲死后，因为有引导官军剿王杲功劳，被晋升为建州左卫都督[6]。父亲塔克世晋升为指挥使[7]。觉常刚从抚顺所放回来以后，去古勒城的时候，被阿台拘留寨中，劝他归顺，共同扰边。觉常则坚决不从。阿台拘禁不放[8]。当官军于万历十一年二月，讨伐阿台、阿海的时候，塔克世为了营救父亲也先于官军入城，以致父子都困在古勒城中。图伦城主尼堪外兰乘这个机会，投到明边关将下，深得宠信。官军城破以后，觉常刚死于火焚，塔克世被官军误杀，结果父子都死于这次战祸。
努尔哈赤父祖死后，他还没有得到朝廷的任命，处于舍人或外郎的地位。所以，努尔哈赤是以建州左卫一个小外郎的身份开始了自己的政治生涯。在努尔哈赤的眼中进谗言的尼堪外兰，也就成为杀努尔哈赤父祖的仇人和首先应讨伐的目标。
阿台、阿海势力削弱了，建州有名的首领都死得差不多了。这对于努尔哈赤与尼堪外兰的角逐是十分有利的。另外更有利于努尔哈赤势力迅速发展的因素，是明廷边官的注意力几乎全部放在海西各部，减少了对努尔哈赤活动的gān涉机会。加上海西南北两关争斗及明廷的参战，严重地削弱了海西势力，又为努尔哈赤成就自己的事业减少了相当的阻力。因为这时，王台有二子一孙，二子是康古陆、猛骨孛罗，一孙是歹商。三人争继父祖遗业，相互残杀。叶赫部的逞加奴、仰加奴与王台的旧部白虎赤相勾结，借“三卫”蒙古的兵力，攻击猛骨孛罗和歹商，海西陷于战乱之中。
明廷总兵侍郎周泳鉴于歹商力弱，猛骨孛罗初立，众心还没有归附，请求朝廷给哈达部敕书，以便“弹压”各部。但逞加奴、仰加奴仍不示弱，纠结蒙古部，再次兴兵攻击猛骨孛罗，夺去把吉(原属叶赫部，后为王台占领)等寨。明廷欲立南关，逞加奴、仰加奴要削弱南关，斗争的实质已经不是南北两关的矛盾，而是北关与明廷的矛盾了。于是，辽东边官决意铲除逞加奴、仰加奴[9]。
同年十二月初一日，逞加奴、仰加奴纠结泰宁卫骑兵，借与猛骨孛罗仇杀为名，预谋抢掠开原、辽沈各地，qiáng行向明廷索取敕书，想称雄于女真各部。辽东巡抚都御史李松再三派人宣谕利害，二人都不肯听从。于是李松与李成梁密谋：以发给敕书为名，引诱逞加奴、仰加奴及其子兀孙孛罗、哈儿哈麻和白虎赤等，前往关王庙，设伏兵进行杀害。逞加奴、仰加奴不识其计，结果逞加奴等人及另外三百一十多名随从几乎全被杀死在关王庙。幸而逃出者又被李成梁的中固城(今开原县中固)伏兵掩袭，前后共被斩杀一千二百五十多人[10]。
逞加奴、仰加效死后，其子卜寨、那林孛罗承袭父业，继续与南关歹商、猛骨孛罗互相攻杀，以图报父祖之仇。然而，这时海西各部势力已经大大地削弱了，这就为努尔哈赤势力的兴起，在女真社会内部减少了阻力，创造了极为有利的社会环境。
建州、海西有威望的首领相继死去，女真各部失去了约束力，混乱异常，围绕在建州周围作乱的就有许多部落，其中有苏克苏护河部[11]、浑河部、完颜部(又称王家部、王甲部)、栋鄂部(又称董鄂部、东果部)、哲陈部;长白山有纳殷部(又称内yīn、内音部)、珠舍里部、鸭绿江部[12]。另外，东海有窝集部、瓦尔喀部、虎尔哈部。海西四部又称扈伦四部，即哈达部、叶赫部(朝鲜史称汝许部)、乌拉部(又书兀喇部、忽位温部)、辉发部(朝鲜史拉回波部)。各部之内都有大小首领，各占据一城。大首领足有数百，小首领也有数千[13]。各部蜂起，称王争长，互相战杀，甚至骨肉相残，qiáng者凌弱，众者bào寡，混乱异常[14]。
建州有名的首领死后，争夺左卫掌印都督的职务，已经为大家所瞩目。图伦城主尼堪外兰，自以为引导官军杀死阿台有功，日益亲近边吏。当努尔哈赤追究父祖死难的原因时，明边关将吏曾威胁他说，你不听话，官军将援助尼堪外兰，筑城嘉班(今抚顺市东大甲邦)，作为建州之主。建州部众听到这一消息后，纷纷归附尼堪外兰[15]。当时，努尔哈赤因为父祖死于无辜，要求边将jiāo还尸体，边将照办了，并把塔克世的遗地转给努尔哈赤，另给敕书三十道，马三十匹，又给予都督敕书，及各家敕书。大约也是在这前后，明廷晋升努尔哈赤为都指挥使[16]。这时，由谁来掌管卫事，已经摆在面前，换一句话说，努尔哈赤与尼堪外兰争夺建州领导地位的斗争已经狭路相逢，不可避免了。
努尔哈赤认为尼堪外兰是杀害他父祖的仇人。到边关qiáng烈地要求边将处死尼堪外兰。然而，边将认为努尔哈赤的父祖是官兵“误杀”，不接受他的要求，责令他回家。努尔哈赤忍气吞声地回来时，又遇到尼堪外兰通令他投顺，使他更加气愤。努尔哈赤指责尼堪外兰说，你本来是我父亲的部下，反而令我归顺于你?于是，他决心与尼堪外兰决一雌雄。